Den databeskyttelsesansvarlige har mandat til at sikre, at de dataansvarlige overholder deres databeskyttelsesforpligtelser, og at de registrerede underrettes om deres rettigheder og forpligtelser i henhold til forordning (EU) 2018/1725. Den databeskyttelsesansvarlige sikrer på uafhængig vis, at bestemmelserne i forordning (EU) 2018/1725 anvendes internt, og fører et offentligt register over de behandlinger, som Kommissionen foretager. Kommissionen har udpeget en databeskyttelseskoordinator i hvert generaldirektorat. Antallet bestemmes på grundlag af institutionens størrelse og nødvendigheden af at have kontaktpunkter i de forskellige generaldirektorater. Der er også en særlig databeskyttelsesansvarlig for Det Europæiske Kontor for Bekæmpelse af Svig (OLAF).