Úkolem pověřence pro ochranu osobních údajů je zajistit, aby správci údajů dodržovali své povinnosti v oblasti ochrany dat a dále aby osoby, o nichž se údaje shromažďují, byly informovány o svých právech a povinnostech vyplývajících z nařízení (EU) 2018/1725. Pověřenec jedná nezávisle a zajišťuje, aby byla uvnitř Komise uplatňována ustanovení nařízení (EU) 2018/1725. Zároveň provozuje veřejný rejstřík operací, které v rámci zpracování údajů provádí Komise. Komise jmenuje na každém generálním ředitelství koordinátora ochrany údajů. Důvodem k tomu je jednak velikost této instituce, jednak nutnost mít na každém generálním ředitelství prostředníka. Evropský úřad pro boj proti podvodům (OLAF) má svého vlastního pověřence pro ochranu osobních údajů.
