Generální sekretariát je jakýmsi mozkem Evropské komise. Pod vedením předsedy či předsedkyně Komise je nápomocen sboru komisařů a komisařek a zajišťuje kolegialitu, soudržnost a účinnost činností tohoto orgánu. Generální sekretariát řídí a koordinuje práci Komise s cílem zajistit, aby její iniciativy a operace byly v souladu s politickými směry předsedy či předsedkyně. Generální sekretariát zajišťuje hladké fungování Evropské komise, a to v koordinaci se sekretariáty ostatních orgánů EU a dalšími ústředními útvary. Generální sekretariát zejména: podporuje předsedu či předsedkyni, (výkonné) místopředsedy a místopředsedkyně Komise při plnění jejich úkolů formuje strategické cíle, průřezové politiky a operační priority Komise podporuje institucionální roli a řádnou správu Komise a také rozvoj moderní a transparentní evropské administrativy, která slouží občanům a funguje podle nejpřísnějších pravidel etiky a integrity zajišťuje hladký průběh rozhodovacích procesů Komise společně s kabinetem předsedy/předsedkyně poskytuje poradenství a dohled nad uplatňováním etických pravidel pro členy Komise řídí a koordinuje politickou činnost Komise od jejího počátku až po interinstitucionální jednání s cílem zajistit soudržnost, kvalitu a včasné provádění, a to v souladu se zásadami zlepšování právní úpravy a tvorby politiky založené na důkazech koordinuje politiku Komise v oblasti prosazování práva EU funguje jako prostředník mezi Komisí a ostatními orgány, institucemi a útvary EU je nápomocen předsedovi/předsedkyni Komise jakožto členu/člence Evropské rady a účastníku/účastníci na zasedáních vedoucích představitelů zemí EU poskytuje podporu předsedovi/předsedkyni Komise na summitech se třetími zeměmi, během kontaktů s mezinárodními partnery a na zasedáních mezinárodních organizací a fór, jako jsou OSN a skupiny G7 a G20; funguje jako styčný bod mezi Evropskou komisí a Evropskou službou pro vnější činnost koordinuje práci Komise na politických opatřeních mezinárodního rozměru, včetně provádění Dohody o Evropském hospodářském prostoru a příslušných dohod se Spojeným královstvím řídí provádění Nástroje pro oživení a odolnost a koordinuje tzv. evropský semestr, a to prostřednictvím pracovní skupiny na podporu oživení a odolnosti a ve spolupráci s příslušnými generálními ředitelstvími Komise spolupracuje s nezávislými a specializovanými subjekty, včetně Výboru pro kontrolu regulace, Evropské fiskální rady a jejího sekretariátu, mediační služby a Evropského pověřence pro ochranu osobních údajů ÚtvaryGenerální sekretariát