Il responsabile della protezione dei dati ha il compito di garantire che i responsabili del trattamento dei dati rispettino i propri obblighi di tutela e che gli interessati siano informati dei propri diritti e doveri ai sensi del regolamento (UE) 2018/1725.
Il responsabile della protezione dei dati garantisce in maniera indipendente che le disposizioni del regolamento n. 2018/1725 vengano applicate all'interno dell'istituzione e tiene un registro pubblico delle operazioni effettuate dalla Commissione.
La Commissione ha nominato in ciascuna direzione generale (DG) un coordinatore per la protezione dei dati. Ciò deriva dalle dimensioni dell'istituzione e dalla necessità di avere un referente in ciascuna DG. L'Ufficio europeo antifrode (OLAF) dispone inoltre di un responsabile della protezione dei dati specifico.